ÇOMÜ İlahiyat Fakültesi, 1992 yılında kurulmuştur. Temel İslam Bilimleri, Felsefe ve Din Bilimleri, Din Kültürü ve Ahlak Bilgisi Öğretmenliği ve İslam Tarihi ve Sanatları Bölümleri şeklinde dört bölümden oluşmaktadır. İlk mezunlarını 1999–2000 öğretim yılında veren fakültemizde; lisans, yüksek lisans ve doktora öğretimi yapılmaktadır. Fakültemizde, İlahiyat ve Din kültürü ve Ahlak Bilgisi Öğretmenliği olmak üzere iki eğitim programı yer almaktadır. İlahiyat programında eğitim gören lisans öğrencileri 4 yıllık eğitim süreleri boyunca bölümümüzden çeşitli dersler almaktadırlar.